DNBSEQ-G400: Опыт Беспрепятственного Секвенирования
DNBSEQ-G400 – это платформа нового поколения, которая сочетает оптимизированные оптические и биохимические системы с гибкой системой флоу-клеток для поддержки различных режимов секвенирования. Эта система позволяет быстро завершать процесс секвенирования и обеспечивает пользователям максимально эффективный рабочий процесс.
Основные особенности
Высокая пропускная способность:
- Выход данных за запуск варьируется от 55 Гб до 1440 Гб в зависимости от выбранного режима и типа флоу-клеток.
- Пример: для режима PE150 (с использованием флоу-клеток FCS) – полная загрузка за ~31 час.
Гибкость режимов секвенирования:
- Поддерживаются различные длины чтения, включая SE50, SE100, SE400, PE100, PE150, PE200 и PE300.
- Система использует два типа флоу-клеток:
- FCL (Large): 4 канала на флоу-клетку, позволяющие получать эффективное число чтений от 1500 до 1800 млн.
- FCS (Small): оптимизирован для более быстрого секвенирования с меньшими объёмами данных.
Широкий спектр применений:
- Применима в базовых и клинических исследованиях, судебной экспертизе, сельском хозяйстве и других областях.
Производительность (Примеры параметров)
FCL режим:
- SE50: 75–90 Гб данных за ~14 часов
- SE100: 150–180 Гб данных за ~25 часов
- PE150: 450–540 Гб данных за ~50–56 часов
- PE200: 600–720 Гб данных за ~107 часов
FCS режим:
- SE100: 55 Гб данных за ~13 часов
- PE100: 110 Гб данных за ~22–26 часов
- PE150: 165 Гб данных за ~31–37 часов
- PE300: 180 Гб данных за ~98 часов
Показатели Q30/Q40 – это средние значения для стандартной библиотеки, фактическая производительность зависит от типа образца, качества библиотеки и вставок.
Системные параметры и условия работы
Окружающая среда:
- Температура: 19–25°C
- Относительная влажность: 20–80% (без конденсации)
- Атмосферное давление: 70–106 kPa
- Защита от влаги: IPX0
- Использование: только в помещениях (под 2000 м над уровнем моря)
Конфигурация управляющего компьютера:
- Процессор: 2× Intel Xeon E5 10 ядер по 2.2 ГГц
- ОЗУ: 256 Гб
- HDD: 16 Тб
- SSD: ≥480 Гб
- Операционная система: Windows 10 Enterprise
Питание, размеры и вес:
- Напряжение: 100–240 В, 50/60 Гц, 30 A
- Номинальная мощность: 1200 VA
- Размеры (Д×Ш×В): 1150 мм × 750 мм × 810 мм
- Чистый вес: 200 кг
Сетевое подключение:
- Скорость загрузки:
- 300 Мбит/с – для локальных загрузок
- 4000 Мбит/с – для загрузки Fastq-файлов
- 500 Мбит/с – для анализа данных
- Скорость загрузки:
DNBSEQ-G400 предлагает пользователям беспрепятственный опыт секвенирования с высокой гибкостью, скоростью и качеством данных, что делает его идеальным инструментом для реализации широкомасштабных проектов в области геномики и других данных-емких исследований.